Η Μικροβιολογία αποτελεί κλάδο της Ιατρικής  που επικεντρώνεται στη μελέτη  των μικροοργανισμών, στις διαφορετικές στους ιδιότητες, καθώς και στις κλινικές εφαρμογές τους. Στο Μικροβιολογικό τμήμα, πραγματοποιούνται όλες οι βασικές εξετάσεις για την ανίχνευση των μικροοργανισμών.

Στο Μικροβιολογικό εργαστήριο εκτελούνται τόσο άμεσες μικροβιολογικές εξετάσεις όσο και καλλιέργειες βιολογικών υγρών, που μπορούν να λειτουργήσουν είτε προληπτικά για την αποφυγή κάποιας λοίμωξης είτε ως μέσο παρακολούθησης κάποιας χρόνιας λοίμωξης.

Επίσης  γίνονται εξετάσεις ούρων που αφορούν τόσο στην γενική ούρων όσο και στην εξέταση ούρων με μικροσκόπηση αντίθεσης φάσης (phase contrast) για τον προσδιορισμό της προέλευσης των ερυθρών αιμοσφαιρίων (κύστεως ουρητήρων, νεφρικού σπειράματος κ.α.) σε περιπτώσεις αιματουρίας , ανάλυση σπέρματος (σπερμοδιάγραμμα), ορολογικές και μικροσκοπικές εξετάσεις κοπράνων.

• Καλλιέργεια βιολογικών δειγμάτων (ούρα, κόπρανα, σπέρμα, κολπικό έκκριμα, υγρό τραύματος, δερματικές βλάβες, οφθαλμικό έκκριμα, προστατικό έκκριμα, πτύελα, τραχηλικό επίχρισμα, φαρυγγικό επίχρισμα, ουρηθρικό έκκριμα, ρινικό έκκριμα, πύον) 
• Απομόνωση, ταυτοποίηση και τυποποίηση μικροβίων 
• Έλεγχος ευαισθησίας στα αντιβιοτικά.
• Αντιβιόγραμμα για βακτήρια με πολυαντοχή στα αντιβιοτικά
• Αντιβιόγραμμα για μυκόπλασμα, ουρεόπλασμα
• Mυκητόγραμμα / καλλιέργεια για ανίχνευση διάφορων ειδών Μυκήτων
• Έλεγχος ESBL
• Strept TEST
• Καλλιέργεια Ξέσματος Νυχιών (χεριών-ποδιών) και από διάφορες δερματολογικές παθήσεις.